P. Rico-Logran secuenciar el genoma de la viruela del mono en España

Por Rafael Santiago Medina

San Juan, 26 may (INS).- La secuenciación ha llegado al 100% de los 190 mil pares de bases (letras) del ADN de la viruela del mono en el Instituto de Salud Carlos III (ISCIII). Las muestras para el análisis genómico provinieron de 23 pacientes.

Esta labor de secuenciación masiva permite confirmar que es la variedad de África Occidental la causante de este brote.

Con ello se abren los análisis a la posibilidad de estudios filogenéticos más avanzados que permitirán obtener información adicional sobre su comportamiento y comprender mejor su origen, circulación y difusión. Se trata de una de las secuencias más completas obtenidas hasta el momento.

Esto no es sólo relevante para saber si había algo raro que hubiera mutado en este brote. También aporta valor científico. Entre otras cosas, se podrá indagar en el origen de este virus que, aunque se denomine viruela del mono, no es típico de simios, sino de roedores de zonas boscosas africanas. Se trata de una de las secuencias más completas obtenidas hasta el momento.

Se pudo comprobar con esta secuenciación genómica que las llamadas “variantes” de la viruela del mono no son comparables a las del coronavirus. “La viruela se produce por un virus de ADN, no de ARN”, según se explica. “La tasa de mutación es más baja”, por lo que no cree que este brote pudiera ligarse a un cambio genético en el virus Monkeypox. No se habría hecho, a priori, más transmisible.

La secuenciación llevada a cabo a través del Laboratorio de Arbovirus del ISCIII, en conjunto con las unidades de Genómica y Bioinformática ha contado con las referencias publicadas en los últimos días por otros países (Bélgica, Alemania, Portugal y Estados Unidos) y se ha basado en una tecnología genómica de nueva generación mapeada a partir del genoma de referencia.

El análisis genómico se complementa con una técnica conocida como “ensamblado de novo”. Las secuencias en bruto se terminaron de obtener el pasado lunes por la noche y el análisis de computación se ha realizado en las últimas 36 horas.

Los resultados señalan que las muestras secuenciadas parecen pertenecer al mismo brote detectado en otros países europeos, ya que los genomas obtenidos apenas difieren de los ya secuenciados fuera. En concreto, el análisis realizado en el ISCIII concluye que hay menos de cinco diferencias respecto a la secuenciación llevada a cabo en Alemania.

La secuenciación confirma que el virus de la viruela de los monos del brote que se está produciendo en España es del clado de África Occidental, que es el de menor virulencia entre los conocidos. Es el que se ha identificado por el momento en la mayoría de los países fuera de África implicados en este brote.

Históricamente, se conocen dos secuencias del virus de la viruela del mono ligadas a dos linajes. El que circula en África Central presenta un genoma que se correlaciona con un mayor número de casos de transmisión secundaria y una mayor virulencia. El genoma secuenciado en España es el del “monkeypox” leve. Las zonas geográficas en donde hay ciclos establecidos de circulación del virus se restringe a África subsahariana.

Entre los países endémicos están Nigeria (el linaje leve) y la República Democrática del Congo (el linaje virulento). En estas zonas se han producido brotes esporádicos de la enfermedad en humanos desde 1970, con varios miles de casos en 11 países africanos, y se ha visto un aumento en el número de casos en Nigeria desde el año 2017. INS

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